Название "Спор об атеизме" получила дискуссия, развернувшаяся вокруг статьи Ф.К. Форберга «Развитие понятия религии», где была изложена кантовская позиция на религию как форму моральности. Из трех возможных источников религии: опыта, спекуляции и совести, Форберг отдал предпочтение последнему. «Религия возникает единственно и только из желания доброго сердца, желания, чтобы в мире добро побеждало зло» – писал он. Такая вера, по мысли автора, «так же хорошо может сосуществовать с политеизмом, как и с монотеизмом, так же хорошо – с антропоморфизмом, как и со спиритуализмом». Последовательное проведение такого взгляда на религию заключает в себе выводы граничащие с атеизмом, поэтому статья вышла с предисловием И.Г. Фихте «Об основании нашей веры в божественное мироправление». В нем автор наукоучения отмечает, что хотя и согласен с позицией Форберга, но полагает многие положения статьи «недозревшими» до его собственной точки зрения, согласно которой вера в Бога есть вера в «живой и действующий моральный порядок», и все иные попытки мыслить эту сущность посредством предания ей конечных определений остаются мышлением «самих себя, мысленно умноженных».

В этих радикальных заявлениях Дрезденская оберконсистория прочитала пропаганду атеизма и все номера журнала были изъяты, а их распространение было запрещено. Фихте оскорбили подобные обвинения, так как с его точки зрения атеизм синонимичен аморальности, поэтому в ответ он опубликовал «Апелляции к публике», предполагавшие разъяснение его взгляда на религию. В них он подверг критическому разбору воззрение оппонентов, проповедующих стремление к счастью в рамках философии, что совершенно расходится с открытиями Новейшей философии, то есть наукоучения. «Посредством этой абсолютной противоположности принципов, поскольку мы последовательны, с необходимостью противополагаются друг другу системы нашего мышления, наши философские учения и наши религии. То, что есть единственное истинное и абсолютное для меня, для них вообще не существует, для них оно – химера и выдумка; то, что они считают истинным и абсолютным, есть, согласно мне голое явление, лишенное всякой истинной реальности».